Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RNF148Q8N7C7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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RNF148Q8N7C7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RNF148Q8N7C7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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