Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LTBP4Q8N2S1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LTBP4Q8N2S1 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms