Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC83Q8IWF9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC83Q8IWF9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms