Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMC4Q7Z404 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms