Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PREX2Q70Z35 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PREX2Q70Z35 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PREX2Q70Z35 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PREX2Q70Z35 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PREX2Q70Z35 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PREX2Q70Z35 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PREX2Q70Z35 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PREX2Q70Z35 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PREX2Q70Z35 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PREX2Q70Z35 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PREX2Q70Z35 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
PREX2Q70Z35 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PREX2Q70Z35 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms