Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SYDE1Q6ZW31 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms