Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf139Q6ZV77 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms