Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SRCAPQ6ZRS2 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SRCAPQ6ZRS2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms