Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CCDC137Q6PK04 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CCDC137Q6PK04 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms