Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDC42EP5Q6NZY7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CDC42EP5Q6NZY7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms