Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PRPF40BQ6NWY9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PRPF40BQ6NWY9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms