Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD40Q6AI12 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD40Q6AI12 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms