Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GARNL3Q5VVW2 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms