Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ9

EFCAB2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB2Q5VUJ9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
EFCAB2Q5VUJ9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EFCAB2Q5VUJ9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms