Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAVIN4Q5BKX8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms