Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
KRTAP24-1Q3LI83 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KRTAP24-1Q3LI83 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms