Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VWC2Q2TAL6 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms