Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SGCAQ16586 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SGCAQ16586 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SGCAQ16586 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SGCAQ16586 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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SGCAQ16586 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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SGCAQ16586 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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SGCAQ16586 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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SGCAQ16586 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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SGCAQ16586 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SGCAQ16586 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SGCAQ16586 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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