Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RPE65Q16518 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RPE65Q16518 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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