Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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CNGA3Q16281 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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CNGA3Q16281 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CNGA3Q16281 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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