Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZFHX3Q15911 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZFHX3Q15911 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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