Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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VAMP3Q15836 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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VAMP3Q15836 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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VAMP3Q15836 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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VAMP3Q15836 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
VAMP3Q15836 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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