Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC85BQ15834 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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