Protein–RNA interactions for Protein: Q15334

LLGL1, Lethal(2) giant larvae protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL1Q15334 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LLGL1Q15334 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LLGL1Q15334 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms