Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NCAPHQ15003 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NCAPHQ15003 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCAPHQ15003 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCAPHQ15003 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NCAPHQ15003 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NCAPHQ15003 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NCAPHQ15003 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NCAPHQ15003 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
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