Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NFIXQ14938 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
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