Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHD4Q14839 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHD4Q14839 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
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