Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMC1AQ14683 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMC1AQ14683 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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