Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MDC1Q14676 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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