Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SCARB2Q14108 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SCARB2Q14108 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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