Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KLF9Q13886 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms