Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CDH18Q13634 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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