Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C1orf61Q13536 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms