Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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GRIK2Q13002 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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GRIK2Q13002 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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GRIK2Q13002 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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GRIK2Q13002 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GRIK2Q13002 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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GRIK2Q13002 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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GRIK2Q13002 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
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GRIK2Q13002 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GRIK2Q13002 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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