Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSPB3Q12988 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSPB3Q12988 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms