Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SREBF2Q12772 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SREBF2Q12772 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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