Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CTDSPL2Q05D32 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTDSPL2Q05D32 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms