Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRNEQ04844 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRNEQ04844 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms