Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
ATP7AQ04656 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP7AQ04656 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms