Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUCB1Q02818 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms