Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CNTN2Q02246 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms