Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFITM3Q01628 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms