Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCN7AQ01118 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCN7AQ01118 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms