Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
E2F1Q01094 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F1Q01094 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms