Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CACNA1BQ00975 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1BQ00975 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms