Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK6Q00534 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms