Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TFAMQ00059 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms