Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP2C1P98194 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2C1P98194 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms