Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VBP1P61758 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VBP1P61758 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VBP1P61758 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VBP1P61758 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VBP1P61758 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VBP1P61758 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VBP1P61758 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VBP1P61758 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
VBP1P61758 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VBP1P61758 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VBP1P61758 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VBP1P61758 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VBP1P61758 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VBP1P61758 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VBP1P61758 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VBP1P61758 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VBP1P61758 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VBP1P61758 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VBP1P61758 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms