Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERVK11-1P61568 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERVK11-1P61568 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms